Возбудителями ВБИ, связанными с гастроинтестинальными манипуляциями чаще всего являются бактерии рода Salmonella (S. oranienburg, S. typhi, S. typhimurium, S. agona, S. kedougou, S. goerlitz, S. newport) и Pseudamonasaeruginosa.
В большинстве случаев источниками инфекции, вызванной сальмонеллами, были пациенты с острыми, подострыми и бессимптомными формами проявления инфекционного процесса. Специалисты, проводившие эпидемиологические расследования, установили, что факторами передачи инфекции являлись эндоскопы и инструменты к ним, не прошедшие адекватную очистку и обеззараживание. Так, в 2003 г. специалистами ТУ Роспотребнадзора в одном из ЛПО г. Москвы расследована вспышка сальмонеллеза, вызванная S. typhimurium, связанная с нарушениями процессов очистки и дезинфекции. В результате этих нарушений во время эзофаго-гастродуоденофиброскопии (ЭГДФС) были инфицированы 9 пациентов. Еще два случая сальмонеллеза, связанных с проведением ЭГДФС, расследованы и зарегистрированы в другом ЛПО г. Москвы в 2004 г. Методом пульс-электрофореза было доказано, что штаммы S. typhimurium, выделенные из клинического материала от больных и из смывов с гастроскопа, имеют полную генетическую идентичность и единое происхождение.
Синегнойная палочка (P. aeruginosa) относится к условно-патогенной микрофлоре. У здоровых людей, по некоторым данным, она может содержаться в зеве (до 7%), слюне (2%) и кале (3-24%). Этот микроорганизм довольно часто является этиологическим фактором воспалительных заболеваний желчевыводящих и дыхательных путей и может передаваться от пациента пациенту посредством неадекватно обеззараженного эндоскопа.
При повышенной влажности и благоприятных температурных условиях P. aeruginosaсохраняет свою жизнеспособность на объектах окружающей среды. В эндоскопических подразделениях резервуарами синегнойной инфекции могут стать трубки и резервуары МДМ, емкости с ирригационными и лекарственными растворами, каналы эндоскопов. Таким образом, при инфекциях псевдомоцадной этиологии потенциальными источниками инфекции могут быть пациенты с острым инфекционным процессом, носители P. aeruginosa(колонизированные пациенты) и объекты больничной среды — резервуары инфекции.
В нескольких работах в общей сложности описаны 45 случаев инфицирования пациентов P. aeruginosaпосле различных гастроинтестинальных исследований. От присоединившейся синегнойной инфекции четверо из них погибли. В большинстве выявленных случаев ВБИ P. aeruginosaбыла выделена из клинического материала, смывов с эндоскопа и некоторых объектов больничной среды. Проведенными расследованиями установлены основные причины внутрибольничного инфицирования пациентов: применение неадекватного дезинфектанта, нарушение режима дезинфекции, недостаточная сушка каналов, нарушение герметичности эндоскопа.
Начиная с 1978 г. описано достаточно много случаев инфицирования пациентов P. aeruginosaпри проведении бронхоскопии. Так, 7 пациентов были инфицированы при проведении санационной бронхоскопии в одном из лечебных учреждений г. Санкт-Петербурга в 1999 г. Эпидемиологическим расследованием установлено, что бронхоскоп обеззараживали без полной разборки клапана всасывания, что способствовало образованию в нем биопленки P. aeruginosaи делало дезинфекцию неэффективной.
В 2005 г. в госпитале г. Монпель (Франция) были выявлены две вспышки ВБИ, вызванные P. aeruginosa, в которых пострадало соответственно 9 и 7 пациентов в результате проведения бронхоскопических исследований. У четырех из них развились инфекционные заболевания дыхательных путей.
Эпидемический подъем заболеваемости туберкулезом органов дыхания населения многих стран мира, и в том числе России, в начале 90-х годов прошлого столетия явился основной причиной увеличения удельного веса микобактерий среди этиологических факторов ВБИ в бронхоскопии. Первые сообщения о развитии туберкулеза легких у пациентов после бронхоскопии были связаны с применением неэффективных в отношении представителей рода Mycobacteriumдезинфицирующих средств или с нарушением процесса очистки эндоскопов. Применение для ДВУ средств на основе глутарового альдегида (ГА) в режимах, эффективных против МБ, значительно уменьшило риски инфицирования пациентов и уже с 1988 г. их связывают преимущественно с нарушением герметичности бронхоскопа или невыполнением стандартов его обработки.
Во время бронхоскопических исследований могут передаваться нетуберкулезные микобактерий, вызывающие инфекционный процесс, сходный по клинической картине с туберкулезом легких. Группу риска по данным заболеваниям составляют пациенты с вторичными иммунодефицитнымй состояниями (онкологическими заболеваниями, ВИЧ-инфекцией). Одна из самых больших вспышек, вызванная М. chelonae, была описана в 1983 г. Возбудитель выделяли из бронхиальных смывов и слюны 72 пациентов. У двух пациентов развилась специфическая инфекция, от которой один пациент погиб.
Во время вспышки, вызванной М. chelonaeв Национальной тайваньской университетской больнице, возбудитель был выделен из бронхиальных смывов 18 пациентов. Легочные проявления болезни имели 8 из них.