Ротавирусная инфекция

Rotavirus Infection

Возбудитель — ротавирус с двуцепочечной РНК семейства Reoviridae; существует много типов дан­ного вируса. Является причиной гастроэнтерита.

Прямое исследование ЭМ фекалий на вирусы предполагает > 80% чувствительности; IEM не требу­ется. Инфекция может быть подтверждена ТИФА, обладающим более высокой чувствитель­ностью.

Серологическая диагностика: ИФА на IgG, IgM и IgA; НИФА.

Коммерческие наборы доступны для ИФА, латекс-агглютинации, гемагглютинации, иммуноблота, точечной гибридизации. Скрининг при латекс-агглютинации должен быть подтвержден други­ми тестами (например, ИФА).

ПЦР — самый чувствительный тест, при котором возможно генотипирование.

Краснуха (немецкая корь)

Rubella (German Measles)

Возбудитель — рубивирус с одноцепочечной РНК. Выявление перенесенного заболевания и вери­фикация иммунитета у беременных важны, поскольку инфекция в первом триместре беремен­ности может вызвать врожденные аномалии, аборт или мертворождение примерно в 30% случа­ев; если инфицирование происходит в первый месяц беременности, то признаки выявляются в 80% случаев. 25—50% случаев являются субклиническими.

  •  При наличии сыпи диагноз ставят в случае, если титр в образце сыворотки в острой фазе > 1:10 или если в фазе реконвалесценции сыворотка взята на 7-й день после появления сыпи.
  •  Если у пациента с краснухой нет сыпи, а в сыворотке, взятой на 14—28-й день после инфицирова­ния, наблюдается 4-кратный подъем титра, это указывает на инфицирование, но необязательно на свежую инфекцию.
  •  Реинфекцию (развивается редко и обычно бессимптомна) можно предположить, если в сыворот­ках, взятых с интервалом ^ 2 недель, наблюдается подъем титра IgG, а IgM не обнаруживаются.
  •  Вирус краснухи, выделенный из амниотической жидкости, указывает на врожденную инфекцию.

Оспа (вариола)

Smallpox (Variola)

Возбудитель — ортопоксвирус с двуцепочечной ДНК семейства Poxiviridae.

Исследование доступно только в CDC.

Кожные пузырьки или их содержимое, струпы, мазок глотки:

  •  Микроскопически выявляются цитоплазматические элементарные тельца (тельца Гварньери) в мазках со дна пораженного участка кожи; неотличимо от коровьей оспы.
  •  Электронная микроскопия кожи показывает вирионы, не отличающиеся от возбудителя коро­вьей оспы.
  •  Вирусные антигены идентифицируются в поврежденной коже методами иммуноцитохимии.
  •  Применяют ПЦР и окрашивание флуоресцирующими антителами вирусов с участка поврежде­ния кожи.
  •  Вирусные серологические тесты
  •  Повышающийся титр нейтрализующих антител в сыворотке в острой фазе и фазе реконвалесцен­ции (2—3 недели спустя) для дифференциации свежей инфекции и первичной вакцинации.
  •  Быстрые методики с содержимым пузырьков для гемагглютинации, преципитации или РСК.
  •  Новейшие методы определения IgM имеют повышенные Ч/С.
  •  Обнаружение типичных оспин при культивации на хориоаллантоисе — устаревший метод.

Лейкоциты снижены в период продромы и повышены в период пустулезной сыпи.

  •  Новые быстрые наборы методик (ИФА) для диагностики гриппа и РСВ имеют Ч/С 50-90% /80- 90%.
  •  Коммерческие наборы доступны для качественного определения 7 респираторных вирусов МФА в образцах материала, взятого непосредственно у пациента, или после роста вируса в клеточной культуре. Набор включает в себя диагностические тесты для РСВ, гриппа А и В, аденовируса, ви­русов парагриппа 1, 2 и 3.

Возбудитель — респираторно-синцитиальный вирус (РСВ)

РСВ является основной причиной бронхиолитов и пневмонии у младенцев и детей раннего возраста.

  •  Наличие сывороточных IgM или 3-4-кратное повышение IgG (ИФА) указывает на свежую ин­фекцию.
  • Вирусная культура гена нуклеопротеина (NP) — золотой стандарт диагностики, но требует 4-6 дней.

СОЭ и лейкоциты у детей могут быть выше нормы.

Мазок со слизистой глотки может выявить множество эпителиальных клеток, содержащих цито­плазматические тельца-включения.

Возбудитель — аденовирус

Является причиной по крайней мере шести клинических синдромов: респираторной инфекции, конъюнктивита, гастроэнтерита у детей, острого геморрагического цистита, генитальных язв и уретрита, заболеваний ЦНС.

  •  ПЦР позволяет обнаружить аденовирусные антигены или нуклеиновую кислоту в тканях и жид­костях организма.
  •  Постановка клеточной культуры может занять 10-12 дней. Метод быстрого центрифугирования занимает 2-5 дней.
  •  Латекс-агглютинация фекалий является менее чувствительным методом, нежели культура.
  •  Прямая ЭМ эффективна для диагностики гастроэнтерита у детей.

Прямое исследование отслоенных клеток методами цитопатологии позволяет провести быструю ди­агностику, но не всегда успешно.

Серологическую диагностику (например, РСК, ТИФА, иммунофлуоресценция) проводят для иден­тификации культурных изолятов. 4-кратный подъем титра в парных образцах сыворотки гово­рит об острой инфекции.

Возбудитель — риновирус

  •  ИФА обеспечивает простую и быструю диагностику.

Лейкоциты могут быть незначительно выше нормы.

СОЭ повышена примерно у 5% пациентов.

Возбудитель — вирус парагриппа

  •  Типоспецифическая диагностика требует восстановления вируса в культуре ткани.

ИФА более чувствительна, но менее специфична, чем РСК. Не используют в рутинных клинических исследованиях.

Численность лейкоцитов изменчива в начале заболевания, позже она возвращается в норму или остается незначительно ниже нормы.

Возбудитель — вирус гриппа А, В

 Серологическая диагностика

  •  Используют быстрые диагностические анализы на грипп А и В путем определения антигенов, ферментов или нуклеиновой килоты прямо в кабинете врача.
  •  Наличие IgM или з® 4-кратное повышение IgG (ИФА, НИФА) указывает на свежую инфекцию. IgM достигают пика во 2-ю неделю, а IgG достигают пика к 4-7-й неделе. IgG указывают на пере­несенную инфекцию и сформировавшийся иммунитет.
  •  РСК и ингибирование гемагглютинации (HAI) могут показать 4-кратное увеличение титра в сы­воротке, взятой в острой фазе и 3 недели спустя.
  •  НИФА-окраска клеток мазка носоглотки.
  •  ОТ-ПЦР имеет чувствительность выше, чем культура.
  • Культура может занять 3 дня, но быстрые методики, например, ТИФА или ИФА дают результа­ты в течение < 24 часов.

Лейкоциты в норме (5000-10000/мкл) с относительным лимфоцитозом. Лейкопения развивается у 50% пациентов. Если численность лейкоцитов > 15000/мкл, то предполагается присоединение вторичной бактериальной инфекции.

Вирус птичьего гриппа (Н5 N1) является подтипом вируса гриппа A. FDA в последнее время оправ­дывает ОТ-ПЦР.

Тяжелый острый респираторный синдром

Пандемия возникает вследствие неизвестного ранее коронавируса, который обусловливает острое диффузное альвеолярное повреждение.

  •  ОТ-ПЦР для определения вирусной РНК.
  •  Вирус может быть выделен или видим при ЭМ; результат подтверждается НИФА и ОТ-ПЦР. Максимальное извлечение вируса (> 90%) происходит на 2—4-й неделе в фекалиях и респираторном материале, а также гс 45% в моче. Уровень виремии достигает пика к 4-5-му дню после развития лихорадки. Вирус выявляют в плазме или сыворотке в < 78% случаев на 3-й день; в 25% случаев на 14-й день. Может определяться > 30 дней во всех образцах.
  •  Серологически специфические антитела класса IgG определяются примерно после 21 дня болезни

(например, НИФА и ТИФА), наблюдается 4-кратный подъем титра. Данный метод неэффекти­вен для ранней диагностики.

Серология и определение антигенов в моче отрицательны для других микроорганизмов (например, Chlamydia pneumonia и psittaci, Mycoplasma pneumoniae, Streptococcus pneumoniae и L. pneu­mophila).

Примерно в 70% случаев выявляют лимфопению с нормальным числом нейтрофилов и моноцитов, в 45% случаев — тромбоцитопению, в 45% — повышение АПТВ и в 45% случаев — повышение D-димеров.

Повышены сывороточная АСТ (78% случаев), АЛТ (56% случаев), ЛДГ (80% случаев), КК (56% слу­чаев) и снижена насыщаемость сыворотки О2.

Тропическая лихорадка

Dengue

Эндемичное тропическое заболевание, возбудителем которого является вирус рода Flavivirus с од­ноцепочечной РНК; переносчики — москиты (например, Aedes aegypti). Известны 4 отдельных серотипа вируса: DEN-1, 2, 3,4, различимые в РСК и реакции нейтрализации. Иммунитет — ти­поспецифичный.

Предположительный диагноз

  •  Серологический ТИФА на IgM (возникают за 5 дней, персистируют месяцы) — это метод выбора; ТИФА на IgG, которые появляются вскоре после IgM и персистируют в течение всей жизни с титром 3= 1280.

Подтвержденный диагноз

  •  Культура положительна на 5-й день (чувствительность < 50%); для культивации также можно использовать аутоптат ткани печени.
  •  Выделение вируса в тканях, сыворотке или ЦСЖ путем ИГИ, НИФА или ТИФА (ТИФА на специфические вирусные антигены вытеснил ИФА).
  •  Повышение специфичных IgG или IgM > 4 раз в ингибировании гемагглютинации. Воз­можна перекрестная реакция с другими флавивирусами и предыдущей вакцинацией.
  •  Определение геномной последовательности вируса в реакции ОТ-ПЦР (чувствительность > 90% в начале заболевания; < 10% спустя 7 дней) все еще остается инструментом отдель­ных исследователей.
  •  Вестерн-блоттинг и реакция нейтрализации при необходимости могут подтвердить остроту инфекции.

Лейкоциты ниже нормы (2000—5000/мкл) с появлением токсических грануляций в лейкоцитах и нейтропении и с большим количеством атипичных лимфоцитов.

Осложнения.

Тропическая геморрагическая лихорацка

  •  Снижение числа тромбоцитов (< 100 000/мкл) с замедлением агрегации, удлинением ПВ и АПТВ. Может развиться ДВС-синдром.
  •  Повышение уровня трансаминаз (500-1000 Ед/л) и билирубина.

Синдром шока при тропической лихорадке.

Желтая лихорадка

Yellow Fever

Возбудитель — представитель рода Flavivirus, переносички — москиты Aedes aegypti.

  •  Серологическая диагностика
  •  ТИФА на IgM (возникают спустя 5 дней после инфицирования, персистируют месяцы) — метод выбора, а ТИФА на специфичные вирусные антигены вытеснен ИФА.
  •  Вестерн-блоттинг и реакция нейтрализации при необходимости могут подтвердить остроту ин­фекции.
  •  ИГИ помогает поставить диагноз при вскрытии.
  •  ТИФА: IgG появляются вскоре после IgM; персистируют всю жизнь.
  •  ОТ-ПЦР все еще инструмент лишь отдельных исследователей.
  •  Культура положительна в первые 4 дня; для культивации также можно использовать аутоптат ткани печени.
  •  Повышены трансаминазы и билирубин.
  •  Биопсия печени для гистологического исследования.

Снижение лейкоцитов (2000-5000/мкл) наиболее выражено на 6-й день, со снижением лейкоцитов в целом происходит и снижение лимфоцитов.

Снижение числа тромбоцитов с замедлением агрегации, удлинением ПВ и АПТВ. Может развиться ДВС-синдром.

В тяжелых случаях развиваются протеинурия и азотемия.

Лабораторные данные свидетельствуют о кровотечении в ЖКТ, что случается часто; возможны ас­социированные олигурия и анурия.

Коровья оспа

Vaccinia

Вакцинный вирус, вызывающий кожную инфекцию при вакцинации против оспы.

  •  Тельца Гварньери (цитоплазматические включения) на участке кожного поражения. Лаборатор­ные данные осложнений
  •  Прогрессирующая коровья оспа. Исключаются злокачественная лимфома, хроническая лимфа­тическая лейкемия, новообразования, гипогаммаглобулинемия и дисгаммаглобулинемия.
  •  Наложение инфекции (например, столбняк).
  •  Поствакцинный энцефалит.

Вирус энцефалита Западного Нила

West Nile Virus Encephalitis

Возбудитель — флавивирус, переносчики — москиты от птиц; заражение может произойти также через продукты крови/органы-трансплантаты, путем лабораторных манипуляций и внутриу­тробно. У 2/а птиц развивается энцефалит, у х/3 — менингит.

  •  Наиболее полезный и самый распространенный тест — ТИФА на определение IgM в ЦСЖ (по­скольку антитела появляются в ЦСЖ раньше, чем в сыворотке); в 90% случаев они определимы на 3-5-й день у пациентов с симптомами заболевания, при этом РНК из крови может исчезнуть. Если на начальных стадиях заболевания тест отрицателен, то его необходимо повторить. Может оставаться положительным Щ 1 года. IgM специфичнее, чем IgG и могут представлять перенесен­ную инфекцию. IgG появляются спустя примерно 5 дней после появления IgM; переход резуль­тата в позитивный или повышение титра в период между острой фазой и фазой реконвалесцен­ции подтверждает диагноз. Может быть перекрестная реакция с другими флавивирусами (на­пример, энцефалит Св. Луиса, тропическая лихорадка) или с прививкой против желтой лихорадки, что делает необходимым проведение реакции вирусной нейтрализации для под­тверждения. У ТИФА Ч/С выше, чем у НИФА. У реакции нейтрализации антител специфич­ность еще выше, но проводится она только в специализированной лаборатории.
  •  ПЦР ЦСЖ идентифицирует вирус в < 60% случаев. Если IgM отрицательны, этот метод самый полезный. В ЦСЖ выявляют повышение уровня белка, лимфоцитарный плеоцитоз и нормаль­ный уровень глюкозы; положительный результат культуры бывает редко. Может быть положи­тельна на IgG (редко) и IgM.
  •  Определение вирусной РНК (путем ОТ-ПЦР) применяют для диагностики и скрининга доноров крови. Этот метод высокоэффективен у серонегативных иммунокомпрометированных пациен­тов. Определение вирусной РНК в моче также помогает установить диагноз.
  •  Реакция нейтрализации бляшкообразования (НБО/PRNT) используется для подтверждения ре­зультатов CDC и лаборатории отдела здравоохранения (США).
  •  Культура применяется для скрининга москитов и птиц; уровень человеческой виремии низкий и непродолжительный.
  • Также применяют метод инокуляции сердечной крови в новорожденных мышат.
  •  ПЦР аутоптата ткани головного мозга положительна в > 80% случаев; также применяют специ­фичное окрашивание при ИГИ.

У одного из пяти инфицированных развивается умеренный гриппоподобный синдром; у одного из 150 развивается менингоэнцефалит.

В начальной диагностике необходимо исключить излечиваемые причины менингита/энцефалита, которые можно быстро распознать (например, бактерии, вирус герпеса, энтеровирусы).

Донорская кровь также должна быть проверена (например, реакция амплификации нуклеиновой кислоты).

Большинство диссеминированных грибковых инфекций или грибковых инфекций ЦНС характерно для иммуносупрессивных пациентов.

Грибковые/дрожжевые инфекции и их возбудители:

  •  Aspergillus fumigatus и другие виды (аспергиллез);
  •  Blastomyces dermatides (бластомикоз);
  •  Candida albicans (кандидоз);
  •  Coccidioides immitis (кокцидиомикоз);
  •  Cryptococcus neoformans (криптококкоз);
  •  Geotrichosis candidum;
  •  Histoplasma capsulatum (гистоплазмоз);
  •  Pneumocystis jiroveci (ранее carinii);
  •  Rhinosporidiosis seeberi;
  •  Sporothrix schenckii (споротрихоз).

Резюме лабораторных исследований грибковых инфекций